Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Cldn34c1Q8K193 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Cldn34c1Q8K193 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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