Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SbsnQ8CIT9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SbsnQ8CIT9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SbsnQ8CIT9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SbsnQ8CIT9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SbsnQ8CIT9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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SbsnQ8CIT9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms