Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacnb2Q8CC27 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacnb2Q8CC27 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cacnb2Q8CC27 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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