Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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