Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rbbp5Q8BX09 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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