Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nup93Q8BJ71 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms