Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 595 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Frmd3Q8BHD4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Frmd3Q8BHD4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Frmd3Q8BHD4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Frmd3Q8BHD4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Frmd3Q8BHD4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Frmd3Q8BHD4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Frmd3Q8BHD4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Frmd3Q8BHD4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Frmd3Q8BHD4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd3Q8BHD4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Frmd3Q8BHD4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms