Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Liat1Q810M6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms