Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc29Q80VM3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms