Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17leQ7M764 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17leQ7M764 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17leQ7M764 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17leQ7M764 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp17leQ7M764 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp17leQ7M764 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17leQ7M764 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp17leQ7M764 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp17leQ7M764 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Usp17leQ7M764 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Usp17leQ7M764 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp17leQ7M764 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp17leQ7M764 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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