Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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