Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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