Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtminQ6P9S1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms