Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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