Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg16l2Q6KAU8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg16l2Q6KAU8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg16l2Q6KAU8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg16l2Q6KAU8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg16l2Q6KAU8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg16l2Q6KAU8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg16l2Q6KAU8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg16l2Q6KAU8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg16l2Q6KAU8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg16l2Q6KAU8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg16l2Q6KAU8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg16l2Q6KAU8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atg16l2Q6KAU8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atg16l2Q6KAU8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atg16l2Q6KAU8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atg16l2Q6KAU8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg16l2Q6KAU8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms