Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms