Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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