Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Sdc3Q64519 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Sdc3Q64519 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Sdc3Q64519 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Sdc3Q64519 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Sdc3Q64519 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Sdc3Q64519 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Sdc3Q64519 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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