Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms