Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufaf2Q59J78 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms