Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnl1Q52KE7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnl1Q52KE7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms