Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Syne3Q4FZC9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syne3Q4FZC9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Syne3Q4FZC9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Syne3Q4FZC9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Syne3Q4FZC9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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