Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Snx27Q3UHD6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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