Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ulk3Q3U3Q1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ulk3Q3U3Q1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ulk3Q3U3Q1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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