Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms