Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

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Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm2Q3TWN3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm2Q3TWN3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm2Q3TWN3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms