Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rtl9Q32KG4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl9Q32KG4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms