Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Traf3ip1Q149C2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Traf3ip1Q149C2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms