Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms