Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms