Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms