Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms