Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms