Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms