Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms