Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms