Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms