Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmsP97355 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SmsP97355 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SmsP97355 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SmsP97355 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SmsP97355 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmsP97355 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmsP97355 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmsP97355 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmsP97355 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmsP97355 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmsP97355 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmsP97355 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmsP97355 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmsP97355 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmsP97355 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmsP97355 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmsP97355 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SmsP97355 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmsP97355 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmsP97355 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SmsP97355 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmsP97355 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms