Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps11P62281 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rps11P62281 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms