Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms