Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d1P61080 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms