Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Polr2iP60898 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Polr2iP60898 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Polr2iP60898 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Polr2iP60898 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Polr2iP60898 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Polr2iP60898 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Polr2iP60898 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Polr2iP60898 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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