Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gsc2P56916 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gsc2P56916 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gsc2P56916 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gsc2P56916 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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