Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms