Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt1P46096 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt1P46096 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms