Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms