Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms