Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms