Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DesP31001 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DesP31001 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DesP31001 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DesP31001 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DesP31001 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DesP31001 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DesP31001 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DesP31001 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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