Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp3P28862 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms